Unión Magdalena regresó de la segunda división luego de haber descendido en 2005. El conjunto samario, en su primera temporada clasificó sorpresivamente en la última jornada de la Liga I-2019 y se quedó con el octavo cupo a los cuadrangulares. Pasaron 15 años para que el ciclón volviera a jugar las finales del fútbol colombiano.
En 2003, el conjunto samario clasificó en ambos semestres. El último que jugó fue el segundo de ese año y clasificó al grupo A de las rondas finales para disputar los cuadrangulares.
Coincidencialmente, el conjunto de Unión Magdalena compartió el grupo con Millonarios y Pasto, dos equipos con los que también está en los cuadrangulares de la Liga I-2019. En ese entonces, Cali fue el equipo que completó el grupo y que terminó clasificando a la final, que perdió con Tolima.
Los samarios quedaron terceros con nueve puntos, tres menos que el líder. Le ganó y empató con Pasto, igualó con Cali y, perdió y ganó contra Millonarios. Dos años después tuvo que descender a la segunda división.